PubMed數據庫檢索系統及相關檢索方法是什麼

這是我們為大家提供的一篇介紹PubMed數據庫檢索系統及相關檢索方法的文章，接下來就讓我們一起來了解一下吧!

PubMed是美國國家醫學圖書館(NLM)所屬的國家生物技術信息中心(NCBI)開發的因特網生物醫學信息檢索系統，位於美國國立衛生研究院(NIH)的平台上。該系統通過網絡途徑免費提供包括MEDLINE在內的自1950年以來全世界70多個國家4300多種主要生物醫學文獻的書目索引和摘要，並提供部分免費和付費全文鏈接服務。PubMed提供免費的MEDLINE、PREMEDLINE與其它相關數據庫接入服務，MEDLINE是一個擁有1億字條以上的巨大數據庫。PubMed也包含著與提供期刊全文的出版商網址的鏈接，來自第三方的生物學數據，序列中心的數據等。本文擬概述PubMed系統的特點、功能及相關的檢索方法。

1PubMed系統的主要特點

1.1詞匯自動轉換功能(automatic term mapping)PubMed主頁的檢索提問框中鍵入檢索詞，系統將按順序使用如下4種表達或索引，對檢索詞進行轉換後再檢索。

1.2MeSH轉換表(MeSH Translation Table)包括MeSH詞、參見詞、副主題詞等。如果系統在該表中發現了與檢索詞相匹配的詞，就會自動將其轉換為相應的MeSH詞和TextWord詞(題名詞和文摘詞)進行檢索。

1.3刊名轉換表(Journal Tanslation Table)包括刊名全稱、MEDLINE形式的縮寫和ISSN號。該轉換表能把鍵入的

刊名全稱轉換為“MEDLINE縮寫[Journal Nanme]”後進行檢索。如：在檢索提問框中鍵入：“newe ngland journal of medicine”，PubMed將其轉換為“NEng1JMed[JournalName]”後進行檢索。

1.4短語表(Phrase list)該表中的短語來自MeSH、含有同義詞或不同英文詞匯書寫形式的統一醫學語言系統(UMLS:Unified Medical Language System)和補充概念(物質)名稱表[Supplementary Concept(Substance)Namd]。如果PubMed系統在MeSH和刊名轉換表中未發現與檢索詞相匹配的詞，就會查找短詞表。

2強制檢索功能

在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入一個短語後點擊“Go”，系統會高速用自動轉換功能查找到相應的匹配詞後再進行檢索;但是，當鍵入的詞語無匹配詞時，PubMed就會將鍵入的詞語斷開後再重復上述自動詞匯轉換過程，若仍然沒有匹配詞，系統就將短語分解成單詞，再用AND聯在一起全部字段中檢索。很明顯，這樣檢索的結果是不符合用戶要求的。因此，PubMed允許使用雙引號(“”)來強制系統進行短語檢索。例如，在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入“liver cancer operation”，並用雙引號引起來，然後點擊“go”，系統會將其作為一個不可分割的詞組在數據庫的全部字段中進行檢索。使用雙引號檢索，會自動關閉詞匯轉換功能。

3鏈接功能

3.1鏈接相關文獻PubMed系統中的每條文獻記錄均有一個相關文獻鏈接，在檢索結果的顯示狀態下，每條記錄的右邊均有與檢索主題內容密切相關的超鏈。點擊該鏈，系統按文獻的相關度從高到低顯示相關文獻。

3.2鏈接外部資源PubMed提供從檢索結果到期刊全文、生物學數據、序列中心等的鏈接。該功能通過鏈接上述資源 站點的方式來實現。在檢索結果顯示狀態下，點擊“Linkout”進入相關網站

4主要檢索方法

4.1主題檢索在PubMed主頁的提問框中鍵入英文單詞或短語(大寫或小寫均可)後回車或點擊“Go”，PubMed即時用詞匯自動轉換功能進行檢索，並將檢索結果直接顯示在主

頁下方。例如：鍵入“liver cancer operation”後回車或點擊“Go”，PubMed開始檢索並將檢索結果顯示出來。如果檢索結果不符合要求，可以在提問框中增加或刪除詞語，或者在Details狀態下來修改檢索式，也可使用Limits選擇限定條件後再進行檢索。此外，用戶可根據需要使用通配符“*”或雙引號進行截詞檢索或強制檢索。為提高文獻檢出的准確率，推薦使用主題詞檢索，例如需檢索哮喘的藥物治療方面的文章，可先在開始菜單中選擇MesH Database，輸入檢索詞，但此外不能輸入有運算符的語句，如“asthma AND therapy”，在MesH菜單中選擇規范的主題詞，“Asthma”，根據檢索需要，再選擇相應的副主題詞“drug therapy”在search PubMed中形成“Asthma/drugtherapy[MesH]”的檢索式，執行檢索。4.2著者檢索在提問框中鍵入著者姓氏全稱和名字的首字母縮寫，格式為：著者姓空格名字首字母縮寫，例如smity ja，然後回車或點擊Go，系統會自動到著者字段去檢索，並顯示檢索結果。如果在錄入了著者的姓氏，系統將首先在MeSH轉換表中查找該著者的姓。查到後，系統檢索主題字段和題名與文摘字段，否則，系統將在全部字段中檢索。如果在著者姓名前後使用雙引號，並用著者字段標識——[au]加以限定，如“smithja”[au]，系統只檢索著者字段[1-3]。

4.3刊名檢索在提問框中鍵入刊名全稱或MEDLINE形式的簡稱、ISSN號，例如：J child Psychol Psychiatry，或0021-9630，然後回車或點擊Go，系統將在刊名字段檢索，並顯示檢索結果。

4.4高級檢索功能為了得到更為准確的檢索結果，用戶可充分利用PubMed所提供的高級檢索功能。在PubMed首頁檢索框下，系統提供了5個功能按鈕通過利用這5個功能，能夠使用戶的檢索更為高效。

4.4.1Limits功能有如下限制檢索功能：將檢索范圍限制在某個作者范圍;將檢索范圍限制在某個期刊;設定搜索包含全文、免費全文、文摘的論文;將檢索范圍限制在出版、收錄的某時間段;將搜索范圍限定在特定的性別組、年齡組;將搜索范圍限定在人類或動物學;將檢索范圍進行子集限制;對論文類型進行限定。

4.4.2Preview/Index功能①預覽檢索結果數量在檢索框中輸入檢索詞後，點擊後，用戶能夠得到該檢索詞檢索結果數量，如需縮小檢索范圍可在此基礎上在檢索框中繼續添加檢索詞，點擊，能夠再次得到新的檢索詞的檢索結果數量，通過該功能用戶可以根據需要來調整檢索策略;②字段限制在頁面下端的檢索界面中，從下拉菜單中選擇檢索字段，在檢索框中輸入檢索詞，根據檢索需要，點擊布爾邏輯運算符添加到檢索詞中進行再限制檢索，其目的能夠縮小檢索范圍，使用戶能夠快速地找到需要檢索的文章，最後點擊進行檢索結果預覽;③Index選詞功能在檢索框中輸入檢索詞，點擊，系統顯示詞表，並顯示該檢索詞檢索結果數量，在詞表中選擇檢索詞，選擇布爾邏輯算符，選中的檢索詞將出現在頁面上方檢索框，並按選中布爾邏輯運算符進行運算。

4.4.3History功能History功能中保留著所有的查詢方案與查詢結果。History界面能夠為用戶提供歷史中的檢索方案、檢索時間以及檢索結果。與Preview/Indea功能中的預覽功能不同，預覽功能只能顯示最近檢索的三條記錄，而History功能能夠為用戶提供最近的100條檢索記錄。需要注意的是當檢索記錄超過100條時，系統將會依次將最早的記錄刪除。點擊，系統將刪除History功能及Preview/Index功能中保留的記錄。

4.4.4Clipboard剪切板功能剪切板功能能夠為用戶提供暫時保存檢索論文的服務，將論文添加到剪切板後用戶能夠采用打印或保存等方式對剪切板中保存的檢索論文進行處理。剪切板能夠同時保存最多500條記錄，當8h內用戶沒有任何操作，保存將會自動刪除。

4.4.5Details功能Details功能用於用戶查看檢索策略。在QueryTranslation框內顯示了用戶在檢索框中輸入檢索詞檢索，系統實際所采用的檢索策略。在QueryTranslation框下依次為Result、Translations、Database以及UserQuery4部分。Result顯示了檢索結果總條數，點擊該數字可回到檢索結果界面。Translation顯示檢索框中檢索詞在實際檢索中所轉換的檢索式。Database顯示進行檢索的數據庫。UserQuery顯示了用戶檢索時在檢索框中所輸入的檢索詞[4，5]。

5檢索技巧

5.1多項單詞邏輯組合檢索PubMed支持布爾邏輯算符“AND”、“OR”、“NOT”進行再限制檢索，其目的能夠縮小檢索范圍，使用戶能夠快速地找到需要檢索的文章。

5.2截詞檢索截詞符號為“*”，表示0至多個字符，如檢索詞為“gene*”，PubMed可將以gene開頭的，但結尾不盡一樣的所有單詞為檢索詞的文章檢索出來。此外，也可將截詞符號“*”放在某一單詞的中間或其它部位進行檢索。截詞檢索方法有利於不同寫法的字或詞的論文檢索或者是當用戶對某一醫學詞的寫法拿不准時時行論文檢索。

5.3短詞檢索對需要以詞組形式出現的2個或2個以上的檢索詞，為保證系統不執行檢索詞自動轉換功能，這就需要在檢索詞組上加雙引號，從而將雙引號內的詞組作為一個整體進行論文檢索。

以上就是我們為大家提供的介紹PubMed數據庫檢索系統及相關檢索方法的文章，希望對大家有所幫助！