Server 2008 作為伺服器作業系統，安全預設與桌面版大異其趣。

IE 強化安全性設定 (IE ESC)

預設啟用，瀏覽網站需手動加入「信任網站」才能正常執行腳本/ActiveX。伺服器環境安全，但桌面使用極不便。

UAC 使用者帳戶控制

同 Vista 機制，可降低風險，但內建 Administrator 帳戶未受限制（不同於 Vista），需自行建立標準帳戶日常使用。

防毒/防火牆建議

• 防火牆： BlackICE 黑冰（主機型入侵防禦）。
• 防毒： 卡巴斯基 7.0 伺服器版、Symantec Endpoint Protection 伺服器版。
• 內建 Windows 防火牆僅適合非伺服器用途，無法抵禦針對性攻擊。